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    目标区域甲基化测序(TBS测序)
    目标区域甲基化测序(TBS测序)

    一、产品概述


    DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址,能够在不改变DNA序列的前提下澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址,改变遗传表现澳洲幸运5正规官网网址。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。大量研究表明澳洲幸运5正规官网网址,DNA甲基化能引起染结构澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址、DNA构象澳洲幸运5正规官网网址、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。



    TBS全称Targeted Bisulfite Sequencing澳洲幸运5正规官网网址,即目标区域甲基化测序澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。BSP (Bisulfite Sequencing PCR)结合高通量测序的TBS满足几个到上百个基因/位点的验证需求, 具有高通量、低成本的优势, 广泛用于临床大样本多位点的甲基化 biomarker 筛选及高水平文章甲基化验证环节澳洲幸运5正规官网网址。


    澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址、实验原理


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    WGBS是基于重亚硫酸盐的甲基化分析方法,首先通过Bisulfite对样本DNA进行处理澳洲幸运5正规官网网址,将未甲基化的C碱基转化为U碱基澳洲幸运5正规官网网址,而甲基化的C碱基则不会改变澳洲幸运5正规官网网址,进行PCA扩增后U碱基会变成T澳洲幸运5正规官网网址,与原本甲基化的C碱基区分开澳洲幸运5正规官网网址,再结合高通量测序技术,可绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。RRBS是利用限制性内切酶对基因组进行酶切,经Bisulfite处理澳洲幸运5正规官网网址,对基因组CpG区域进行测序的技术澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。


    三澳洲幸运5正规官网网址、应用方向


    • 临床大样本甲基化 Biomarker 筛选

    • 模式生物发育甲基化谱研究

    • 疾病及肿瘤调控机制研究

    • 遗传育种(动物)甲基化研究

    • 无参基因组物种甲基化研究



    四、应用案例


    DNA methylation and copy number variation profiling of T-cell lymphoblastic leukemia and lymphoma.(Blood Cancer Jornal,2020,IF=8.023)

    作者通过主成分分析(PCA)澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址,探索成人和儿童T-ALL和T-LBL患者样本以及参考样本的全基因组DNA甲基化模式(图1)澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。PCA没有将T-ALL和T-LBL投影为单独的集群澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址,也没有将第一和第二主成分中的患者年龄组分别聚类(图1)。然而澳洲幸运5正规官网网址,非恶性参考样本(骨髓和淋巴结样本)与T-ALL和T-LBL样本分开聚集证实了正常组织和恶性组织之间存在较大的甲基化变异澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。该文章进一步分析了T细胞淋巴母细胞恶性肿瘤中基于DNA甲基化的异质性澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址,并探究可用于区分两种疾病的表观遗传标记澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址,以深入了解两种肿瘤不同临床表现背后的生物学机制,并揭示新的治疗靶点和策略澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。

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