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    简化基因组甲基化测序(RRBS)
    简化基因组甲基化测序(RRBS)

    一澳洲幸运5正规官网网址、产品概述


    DNA甲基化是最早被发现澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一澳洲幸运5正规官网网址。DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式澳洲幸运5正规官网网址,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现澳洲幸运5正规官网网址。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。大量研究表明澳洲幸运5正规官网网址,DNA甲基化能引起染结构澳洲幸运5正规官网网址、DNA构象澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变澳洲幸运5正规官网网址,从而控制基因表达澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。


    强化版简化基因组甲基化测序(Improved Reduced Representation Bisulfite Sequencing)是通过 MSPI 酶切富集基因组 DNA 上 CCGG 位点的片段澳洲幸运5正规官网网址,经Bisulfite 处理和高通量测序澳洲幸运5正规官网网址,进行全基因组范围、单碱基分辨率的甲基化测序澳洲幸运5正规官网网址,广泛用临床及哺乳动物全基因组范围甲基化研究,人样本可以检测高达 8M 以上有效 CpG 位点, 覆盖>90%的 CpG 岛, >85%的启动子澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。


    澳洲幸运5正规官网网址、实验原理


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    RRBS是基于重亚硫酸盐的甲基化分析方法澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址,首先利用限制性内切酶对基因组进行酶切,经Bisulfite处理,对基因组CpG区域进行测序的技术澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。


    三澳洲幸运5正规官网网址、应用方向


    • 临床大样本甲基化 Biomarker 筛选

    • 模式生物发育甲基化谱研究

    • 疾病及肿瘤调控机制研究

    • 遗传育种(动物)甲基化研究

    • 无参基因组物种甲基化研究


    四澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址、应用案例


    Epimutations in developmental genes underlie the onset of domestication in farmed European sea bass.( Mol Biol Evol,2019,IF= 14.797).

    本研究通过RRBS测序澳洲幸运5正规官网网址,比较了早期驯化的 (N=12)与野生的(N=12) 欧洲鲈鱼在驯化过程中DNA甲基化变化,发现早期驯化的鲈鱼与野生的没有遗传差异,但在不同胚胎起源的组织中发生DNA甲基化变化澳洲幸运5正规官网网址。这些甲基化突变与经过25年选择性育种后的胞嘧啶至胸腺嘧啶多态性显著重叠澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址,表观突变基因与正选择基因一致。结果表明驯化初始阶的表观变异(epimutation)是一个重要事件澳洲幸运5正规官网网址澳洲幸运5正规官网网址。

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